7月31日，国税局干了一件大事。
发布了首个跨境运输行业的税收指引——《国际运输涉税服务指引》。这是首次专门针对【国际运输】这个细分领域，出的系统性文件。那今天这篇文章，正启商务就用大白话，带大家把这个指引里，和我们外贸企业、跨境卖家相关的内容，做一次讲解。尤其是出口退税板块，很多卖家一直搞不明白，这次一次性讲清楚。
（1）国际运费发票，不能抵税
指引中明确了：境内企业提供国际运输服务，如果取得了相关资质，适用增值税零税率；没取得资质的，适用增值税免税。他们开具的发票，99%的概率不能用来抵扣我们的增值税进项，只能作为成本凭证入账。
那还有1%是什么情况呢？
① 收到的物流账单里，除了国际运输的海运费/空运费，还包含装卸搬运费、报关服务费、仓储费等，物流辅助服务费，那这部分税率6%，是可以开具增值税专用发票，用于抵扣进项的。
② 假设我们的货，从义乌工厂运到宁波港，再从宁波港海运到美国。物流商把国内段（义乌→宁波）和国际段（宁波→美国）分开开票，那么国内段的运输，是可以开专票抵扣的。如果物流商把两段运输混在一起，只开一张国际运输的免税发票，那就没法抵扣。
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（2）帮别人集货，这条帮你省钱！
那针对不只是自己卖货，还帮别的卖家拼柜、集货、订舱的卖家，指引明确：纳税人提供的直接或者间接国际货物运输代理服务，免征增值税。
但要注意2个硬性条件：① 你向客户收的代理费 + 你付给船公司/航空公司的运费，必须通过银行转账结算（不能现金、不能私账）；② 客户要求开票时，你必须全额开增值税普通发票，不能开专票。
（3）委托境外公司，有代扣代缴义务
指引的"走出去篇"提到：如果我们委托境外运输企业提供服务（比如直接找外国船公司订舱、找外国航空公司发货），可能触发以下义务：增值税和企业所得税的代扣代缴。但中国与大多数国家签订的税收协定中，国际运输所得采用"居民国独占征税权"原则，利润只在运输企业自己的国家交税，中国不收企业所得税。因此大部分情况下，我们只需要让财务或代理会计确认一下增值税要怎么处理。
（4）出口退税，运输费用怎么处理？
这是很多卖家提到的问题。指引虽然没有直接写"出口退税怎么算"，但它一定程度上影响了我们出口退税的申报逻辑。我们分两类企业来说。
① 生产企业（免抵退）：你自己生产货物出口，退税按"出口销售额 × 退税率"计算，你支付的国际运费，属于销售费用，不影响退税计算，但影响你的利润。② 外贸企业（免退税）：你从别人那里买来货物再出口，退税按"购进货物金额 × 退税率"计算，你支付的国际运费，同样属于销售费用。不影响退税计算，但影响利润。
那运输费用和出口退税到底什么关系？
一方面，国际运费是你为了把货卖出去花的钱，属于期间费用，不是货物成本的一部分。所以，它不参与出口退税的计算，不能单独申请退税，只能作为费用，在企业所得税前扣除。
另一方面，运输方式会影响出口报关金额。
FOB条款下，运费由买家承担，报关金额就是货物本身的价格，运费不包含在内。CIF条款下，运费由你承担，报关金额包含了货物价格+运费+保险费。而出口退税是按报关单上的FOB价来算的。如果你报的是CIF价，税局会帮你把运费和保险费扣掉，按FOB价算退税。所以，CIF条款下，你付的运费越多，报关金额越高，但税务局扣掉的运费也越多，最终退税基数不变。
（5）涉税风险提醒
① 物流公司资质风险。委托的物流公司如果没有国际运输资质，就只能享受免税，不能享受零税率。虽然对你没直接影响，但如果它因资质问题被税务局盯上，可能牵连到你的发票被协查。
② 收入确认风险。跨境运输涉及多航段、多承运人时，收入怎么分割、发票怎么开，直接影响你收到的账单是否准确。如果物流公司在收入确认上出问题，你拿到的发票也可能有问题。
③ 常设机构风险。如果你在海外仓配备了常驻人员（不只是仓库，还有销售、客服人员），可能构成税收协定里的"常设机构"，需要在当地缴纳企业所得税。这是很多大卖家扩张海外仓时容易忽略的点。
关于这个指引，你还有什么想了解的？或者你在出口退税中遇到过什么和运费相关的奇葩问题？欢迎在评论区留言，咱们一起掰扯清楚。
跨境财税合规：137 1437 6063 郑苏辰
* 本文基于国家税务总局2026年7月31日发布的《国际运输涉税服务指引》整理解读，仅供参考，具体税务处理请以主管税务机关意见为准。